甘薯叶绿体rbcL 基因的克隆与序列分析

王玉华1, 吴忠义2, 贾敬芬1, 张秀海2, 黄丛林2,*
1 西北大学生命科学学院, 西安710069; 2 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心, 北京100097

通信作者:黄丛林;E-mail: conglinh@126.com;Tel: 010-51503801

摘 要:

根据烟草、水稻和菠菜叶绿体的全基因组序列设计引物, 以甘薯的叶绿体基因组DNA为模板, PCR扩增包含甘薯叶 绿体 rbcL 完整基因(GenBank 登录号为 AY942199)在内的一段序列。序列分析表明: 此片段的全长为 1 627 bp, 包括 1 443 bp 的编码区序列在内, 推测编码 480 个氨基酸, 同时构建了此片段的限制性酶切图谱。相似性比较显示, 此基因编码区序 列与烟草、菠菜、小麦、水稻、玉米、矮牵牛、紫花苜蓿、拟南芥、莨菪、葡萄以及甜菜的 rbcL 基因核苷酸的同源性为 85%~98%, 氨基酸的同源性为92%~95%。

关键词:甘薯; 叶绿体基因; rbcL基因; 序列分析

收稿:2008-05-26   修定:2008-07-21

资助:北京市自然科学基金(5062012)、陕西省教育厅自然科学专项基金(06JK175)和西北大学校内基金(05NW43)。

甘薯叶绿体rbcL 基因的克隆与序列分析

王玉华1, 吴忠义2, 贾敬芬1, 张秀海2, 黄丛林2,*
1 西北大学生命科学学院, 西安710069; 2 北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心, 北京100097

Corresponding author: ; E-mail: conglinh@126.com; Tel: 010-51503801

Abstract:

根据烟草、水稻和菠菜叶绿体的全基因组序列设计引物, 以甘薯的叶绿体基因组DNA为模板, PCR扩增包含甘薯叶 绿体 rbcL 完整基因(GenBank 登录号为 AY942199)在内的一段序列。序列分析表明: 此片段的全长为 1 627 bp, 包括 1 443 bp 的编码区序列在内, 推测编码 480 个氨基酸, 同时构建了此片段的限制性酶切图谱。相似性比较显示, 此基因编码区序 列与烟草、菠菜、小麦、水稻、玉米、矮牵牛、紫花苜蓿、拟南芥、莨菪、葡萄以及甜菜的 rbcL 基因核苷酸的同源性为 85%~98%, 氨基酸的同源性为92%~95%。

Key words: 甘薯; 叶绿体基因; rbcL基因; 序列分析

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